Wahana Prestasi bertujuan untuk melatih peserta didik yang memiliki keterampilan sesuai bidang yang dimiliki agar mampu bersaing di skala kecamatan, kabupaten, provinsi, nasional maupun internasional. Adapun Wahana Prestasi di SMA IT Al-Kautsar : OSN (Kimia, Matematika, Fisika dan Kebumian, Biologi dan Ekonomi), Seni dan Sastra.
